En esta versión, los sincorazones han cambiado, el color, la vitalidad, la fuerza y la defensa son algunos de los muchos cambios que podemos observar. Además, se ha añadido una nueva lucha contra un jefe. Se trata de Xemnas, el líder de la Organización. Lo encontraremos en la Capilla, la sala en la que anteriormente luchamos contra Maléfica Dragón.
También, encontraremos dos llaveros nuevos para Sora: Diamond Dust y One Winged Angel, obtenidas por derrotar a Titán Hielo y a Sephiroth en el Coliseo del Olimpo:
-Diamond Dust: Obtenida por vencer a Titán Hielo en el Coliseo del Olimpo. Tiene 3 puntos de ataque y aumenta en 3 los PM máximos.
-One Winged Angel: Obtenida por vencer a Sephiroth en el Coliseo del Olimpo. Tiene 8 puntos de ataque, y reduce en 3 los PM máximos.También se ha agregado un nuevo nivel de dificultad: Proud Mode (Orgulloso). Se ha añadido también la posibilidad de saltar escenas que ya hemos visto en Kingdom Hearts, un final secreto, y muchas cosas más. Además, hay 3 nuevos informes de Ansem (que los puedes ver todos en nuestra sección "Informes de Ansem -Kingdom Hearts-"). El número 11, conseguido por derrotar a Kurt Zisa, el número 12 por derrotar a Sephiroth y, finalmente, el número 13, conseguido por ganarle a Xemnas en Bastión Hueco. ¡Esta versión de Kingdom Hearts si que vino completísima! Aunque es una lástima que no salga ni en América ni en Europa.