
Organización XIII
Una novedad en esta expansión es que, ¡podemos luchar contra todos los miembros de la Organización XIII! Cuando avances en el juego, en Bastión Hueco, se abrirá un nuevo lugar para entrar: Cave of Remembrance. A medida que recorras este lugar llegarás a un cuarto con muchas lápidas, 13 en total. Son portales para luchar contra los miembros de la Organización.
Otro nivel de dificultad
Como era de esperar, Kingdom Hearts II: Final Mix + tiene un nuevo nivel de dificultad, sumamente difícil: Critical Mode (Modo Crítico). También podremos desbloquear un nuevo final secreto.

Terra, the Enigmatic Soldier
También podremos luchar contra Terra, el soldado enigmático, que, después de que reúnas condiciones necesarias, se abrirá un portal en el Castillo Disney, más precisamente en el Salón de la Piedra Angular. Allí, podrás luchar contra E.S.
Como desbloquear la batalla
Para poder luchar contra este jefe secreto, primero debes completar el juego, lo cuál implica vencer el jefe final, Xemnas. El otro objetivo es derrotar a los 5 miembros de la organización XIII en sus batallas “Silhouette Absente”, a las cuáles podremos acceder en diferentes partes del juego. Una vez cumplamos amblos requisitos, se abrirá un portal en el Castillo Disney “Hall of the Corner Stone”, que conduce hacia el jefe secreto.
Remake de Kingdom Hearts Chain of Memories
Esta expansión, contiene también el remake del juego para Gameboy Advance, Kingdom Hearts Chain of Memories (aquí llamado RE: Chain of Memories). El juego contiene el mismo sistema de batalla que en la GBA, sólo que cambia su aspecto a 3D.
Modo Teatro
El juego también incluye el Modo Teatro, en el cual podremos ver todas las escenas de Kingdom Hearts II: Final Mix + y Kingdom Hearts RE: Chain of Memories, tanto en inglés, como en japonés. Para desbloquear este modo, debemos terminar y ganar el Kingdom Hearts II: Final Mix + y el Kingdom Hearts RE: Chain of Memories y tener los datos de cada uno de ellos guardado en la Memory Card. Así se desbloqueará y podremos ver todos los videos disponibles.